Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph3bQ9DA80 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rsph3bQ9DA80 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms