Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rab11fip1Q9D620 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
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