Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J9

4931423N10Rik, MCG52616, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931423N10RikQ9D4J9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4931423N10RikQ9D4J9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
4931423N10RikQ9D4J9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms