Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc43Q9CR29 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms