Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ2

Trim11, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM11, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim11Q99PQ2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim11Q99PQ2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim11Q99PQ2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim11Q99PQ2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim11Q99PQ2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim11Q99PQ2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim11Q99PQ2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim11Q99PQ2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim11Q99PQ2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim11Q99PQ2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim11Q99PQ2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim11Q99PQ2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim11Q99PQ2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim11Q99PQ2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim11Q99PQ2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim11Q99PQ2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim11Q99PQ2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim11Q99PQ2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim11Q99PQ2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim11Q99PQ2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim11Q99PQ2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim11Q99PQ2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim11Q99PQ2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim11Q99PQ2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim11Q99PQ2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim11Q99PQ2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim11Q99PQ2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim11Q99PQ2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim11Q99PQ2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim11Q99PQ2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim11Q99PQ2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim11Q99PQ2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim11Q99PQ2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim11Q99PQ2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim11Q99PQ2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim11Q99PQ2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim11Q99PQ2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim11Q99PQ2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim11Q99PQ2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim11Q99PQ2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim11Q99PQ2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim11Q99PQ2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim11Q99PQ2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim11Q99PQ2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim11Q99PQ2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim11Q99PQ2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim11Q99PQ2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim11Q99PQ2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim11Q99PQ2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms