Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Mrpl27Q99N92 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Mrpl27Q99N92 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Mrpl27Q99N92 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl27Q99N92 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl27Q99N92 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms