Protein–RNA interactions for Protein: Q99K99

Uncharacterized protein C4orf19 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99K99 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q99K99 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q99K99 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q99K99 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q99K99 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q99K99 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q99K99 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q99K99 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q99K99 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q99K99 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q99K99 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q99K99 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q99K99 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q99K99 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q99K99 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q99K99 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q99K99 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q99K99 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q99K99 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q99K99 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q99K99 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Q99K99 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q99K99 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q99K99 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q99K99 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q99K99 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q99K99 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q99K99 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q99K99 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q99K99 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q99K99 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q99K99 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q99K99 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q99K99 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q99K99 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q99K99 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q99K99 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q99K99 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q99K99 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Q99K99 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q99K99 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q99K99 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q99K99 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q99K99 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q99K99 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q99K99 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q99K99 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q99K99 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q99K99 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q99K99 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q99K99 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q99K99 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q99K99 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q99K99 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Q99K99 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Q99K99 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q99K99 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q99K99 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q99K99 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q99K99 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q99K99 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q99K99 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q99K99 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q99K99 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q99K99 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Q99K99 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q99K99 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q99K99 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Q99K99 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Q99K99 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q99K99 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q99K99 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q99K99 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q99K99 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q99K99 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q99K99 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q99K99 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q99K99 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q99K99 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q99K99 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q99K99 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q99K99 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q99K99 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q99K99 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q99K99 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q99K99 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q99K99 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q99K99 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q99K99 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q99K99 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q99K99 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q99K99 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q99K99 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q99K99 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q99K99 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q99K99 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q99K99 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q99K99 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q99K99 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q99K99 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms