Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY1

Tirap, Toll/interleukin-1 receptor domain-containing adapter protein, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TirapQ99JY1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TirapQ99JY1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TirapQ99JY1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
TirapQ99JY1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms