Protein–RNA interactions for Protein: Q924C5

Alpk3, Alpha-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk3Q924C5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Alpk3Q924C5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Alpk3Q924C5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Alpk3Q924C5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Alpk3Q924C5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Alpk3Q924C5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Alpk3Q924C5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Alpk3Q924C5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Alpk3Q924C5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Alpk3Q924C5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Alpk3Q924C5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Alpk3Q924C5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Alpk3Q924C5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Alpk3Q924C5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Alpk3Q924C5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Alpk3Q924C5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Alpk3Q924C5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Alpk3Q924C5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Alpk3Q924C5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Alpk3Q924C5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Alpk3Q924C5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Alpk3Q924C5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Alpk3Q924C5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Alpk3Q924C5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Alpk3Q924C5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Alpk3Q924C5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Alpk3Q924C5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Alpk3Q924C5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Alpk3Q924C5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Alpk3Q924C5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Alpk3Q924C5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Alpk3Q924C5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Alpk3Q924C5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Alpk3Q924C5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Alpk3Q924C5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Alpk3Q924C5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Alpk3Q924C5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Alpk3Q924C5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Alpk3Q924C5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Alpk3Q924C5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Alpk3Q924C5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Alpk3Q924C5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Alpk3Q924C5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Alpk3Q924C5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Alpk3Q924C5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Alpk3Q924C5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Alpk3Q924C5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Alpk3Q924C5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Alpk3Q924C5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Alpk3Q924C5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Alpk3Q924C5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Alpk3Q924C5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Alpk3Q924C5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Alpk3Q924C5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Alpk3Q924C5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Alpk3Q924C5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Alpk3Q924C5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Alpk3Q924C5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Alpk3Q924C5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Alpk3Q924C5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Alpk3Q924C5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Alpk3Q924C5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Alpk3Q924C5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Alpk3Q924C5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Alpk3Q924C5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Alpk3Q924C5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Alpk3Q924C5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Alpk3Q924C5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Alpk3Q924C5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Alpk3Q924C5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Alpk3Q924C5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Alpk3Q924C5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Alpk3Q924C5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Alpk3Q924C5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Alpk3Q924C5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Alpk3Q924C5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Alpk3Q924C5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Alpk3Q924C5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Alpk3Q924C5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Alpk3Q924C5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Alpk3Q924C5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Alpk3Q924C5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Alpk3Q924C5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Alpk3Q924C5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Alpk3Q924C5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Alpk3Q924C5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Alpk3Q924C5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Alpk3Q924C5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Alpk3Q924C5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Alpk3Q924C5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Alpk3Q924C5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Alpk3Q924C5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Alpk3Q924C5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Alpk3Q924C5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Alpk3Q924C5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Alpk3Q924C5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Alpk3Q924C5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Alpk3Q924C5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Alpk3Q924C5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Alpk3Q924C5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.6 ms