Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cts3Q91ZD5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cts3Q91ZD5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cts3Q91ZD5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cts3Q91ZD5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cts3Q91ZD5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cts3Q91ZD5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cts3Q91ZD5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cts3Q91ZD5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cts3Q91ZD5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cts3Q91ZD5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cts3Q91ZD5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cts3Q91ZD5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cts3Q91ZD5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cts3Q91ZD5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cts3Q91ZD5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cts3Q91ZD5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cts3Q91ZD5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cts3Q91ZD5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cts3Q91ZD5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cts3Q91ZD5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cts3Q91ZD5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cts3Q91ZD5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cts3Q91ZD5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cts3Q91ZD5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cts3Q91ZD5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cts3Q91ZD5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cts3Q91ZD5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cts3Q91ZD5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cts3Q91ZD5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cts3Q91ZD5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cts3Q91ZD5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cts3Q91ZD5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cts3Q91ZD5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cts3Q91ZD5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cts3Q91ZD5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cts3Q91ZD5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cts3Q91ZD5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cts3Q91ZD5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cts3Q91ZD5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cts3Q91ZD5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cts3Q91ZD5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cts3Q91ZD5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cts3Q91ZD5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cts3Q91ZD5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cts3Q91ZD5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cts3Q91ZD5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cts3Q91ZD5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cts3Q91ZD5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cts3Q91ZD5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cts3Q91ZD5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms