Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG6

Cnot6l, CCR4-NOT transcription complex subunit 6-like, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6lQ8VEG6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnot6lQ8VEG6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnot6lQ8VEG6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnot6lQ8VEG6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnot6lQ8VEG6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnot6lQ8VEG6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnot6lQ8VEG6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnot6lQ8VEG6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnot6lQ8VEG6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnot6lQ8VEG6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnot6lQ8VEG6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnot6lQ8VEG6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnot6lQ8VEG6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnot6lQ8VEG6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnot6lQ8VEG6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnot6lQ8VEG6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cnot6lQ8VEG6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cnot6lQ8VEG6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cnot6lQ8VEG6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cnot6lQ8VEG6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cnot6lQ8VEG6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cnot6lQ8VEG6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cnot6lQ8VEG6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cnot6lQ8VEG6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cnot6lQ8VEG6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cnot6lQ8VEG6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cnot6lQ8VEG6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cnot6lQ8VEG6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cnot6lQ8VEG6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cnot6lQ8VEG6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cnot6lQ8VEG6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnot6lQ8VEG6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnot6lQ8VEG6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnot6lQ8VEG6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnot6lQ8VEG6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnot6lQ8VEG6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnot6lQ8VEG6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnot6lQ8VEG6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnot6lQ8VEG6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnot6lQ8VEG6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnot6lQ8VEG6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnot6lQ8VEG6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cnot6lQ8VEG6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cnot6lQ8VEG6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cnot6lQ8VEG6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnot6lQ8VEG6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms