Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smg8Q8VE18 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smg8Q8VE18 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Smg8Q8VE18 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smg8Q8VE18 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smg8Q8VE18 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Smg8Q8VE18 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smg8Q8VE18 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smg8Q8VE18 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smg8Q8VE18 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smg8Q8VE18 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smg8Q8VE18 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smg8Q8VE18 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smg8Q8VE18 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smg8Q8VE18 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smg8Q8VE18 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smg8Q8VE18 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smg8Q8VE18 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg8Q8VE18 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg8Q8VE18 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg8Q8VE18 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg8Q8VE18 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg8Q8VE18 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg8Q8VE18 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg8Q8VE18 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg8Q8VE18 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg8Q8VE18 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg8Q8VE18 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smg8Q8VE18 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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