Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1S6

Spire2, Protein spire homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire2Q8K1S6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Spire2Q8K1S6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spire2Q8K1S6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spire2Q8K1S6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spire2Q8K1S6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spire2Q8K1S6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spire2Q8K1S6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spire2Q8K1S6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spire2Q8K1S6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spire2Q8K1S6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spire2Q8K1S6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spire2Q8K1S6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Spire2Q8K1S6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spire2Q8K1S6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spire2Q8K1S6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spire2Q8K1S6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spire2Q8K1S6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spire2Q8K1S6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Spire2Q8K1S6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spire2Q8K1S6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spire2Q8K1S6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spire2Q8K1S6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Spire2Q8K1S6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spire2Q8K1S6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spire2Q8K1S6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spire2Q8K1S6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spire2Q8K1S6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spire2Q8K1S6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spire2Q8K1S6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spire2Q8K1S6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spire2Q8K1S6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Spire2Q8K1S6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Spire2Q8K1S6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spire2Q8K1S6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spire2Q8K1S6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spire2Q8K1S6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spire2Q8K1S6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spire2Q8K1S6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spire2Q8K1S6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spire2Q8K1S6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spire2Q8K1S6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spire2Q8K1S6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spire2Q8K1S6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spire2Q8K1S6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spire2Q8K1S6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spire2Q8K1S6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spire2Q8K1S6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spire2Q8K1S6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spire2Q8K1S6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Spire2Q8K1S6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spire2Q8K1S6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spire2Q8K1S6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spire2Q8K1S6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spire2Q8K1S6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spire2Q8K1S6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spire2Q8K1S6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spire2Q8K1S6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Spire2Q8K1S6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Spire2Q8K1S6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spire2Q8K1S6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spire2Q8K1S6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spire2Q8K1S6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spire2Q8K1S6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spire2Q8K1S6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Spire2Q8K1S6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Spire2Q8K1S6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spire2Q8K1S6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spire2Q8K1S6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spire2Q8K1S6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spire2Q8K1S6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spire2Q8K1S6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spire2Q8K1S6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spire2Q8K1S6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spire2Q8K1S6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spire2Q8K1S6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spire2Q8K1S6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spire2Q8K1S6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spire2Q8K1S6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spire2Q8K1S6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spire2Q8K1S6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spire2Q8K1S6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spire2Q8K1S6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spire2Q8K1S6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spire2Q8K1S6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spire2Q8K1S6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spire2Q8K1S6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Spire2Q8K1S6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Spire2Q8K1S6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Spire2Q8K1S6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Spire2Q8K1S6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Spire2Q8K1S6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Spire2Q8K1S6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Spire2Q8K1S6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Spire2Q8K1S6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Spire2Q8K1S6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Spire2Q8K1S6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spire2Q8K1S6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spire2Q8K1S6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spire2Q8K1S6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spire2Q8K1S6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms