Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9M2

Ccdc15, Coiled-coil domain-containing protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc15Q8C9M2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc15Q8C9M2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc15Q8C9M2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc15Q8C9M2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc15Q8C9M2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc15Q8C9M2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc15Q8C9M2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc15Q8C9M2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc15Q8C9M2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc15Q8C9M2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc15Q8C9M2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc15Q8C9M2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc15Q8C9M2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc15Q8C9M2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc15Q8C9M2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc15Q8C9M2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc15Q8C9M2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc15Q8C9M2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc15Q8C9M2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc15Q8C9M2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc15Q8C9M2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc15Q8C9M2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc15Q8C9M2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc15Q8C9M2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc15Q8C9M2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc15Q8C9M2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc15Q8C9M2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc15Q8C9M2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc15Q8C9M2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc15Q8C9M2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc15Q8C9M2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc15Q8C9M2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc15Q8C9M2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc15Q8C9M2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc15Q8C9M2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc15Q8C9M2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc15Q8C9M2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms