Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ubqln3Q8C5U9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ubqln3Q8C5U9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubqln3Q8C5U9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubqln3Q8C5U9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubqln3Q8C5U9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubqln3Q8C5U9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubqln3Q8C5U9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubqln3Q8C5U9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubqln3Q8C5U9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubqln3Q8C5U9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ubqln3Q8C5U9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubqln3Q8C5U9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubqln3Q8C5U9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubqln3Q8C5U9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubqln3Q8C5U9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubqln3Q8C5U9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ubqln3Q8C5U9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubqln3Q8C5U9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubqln3Q8C5U9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubqln3Q8C5U9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubqln3Q8C5U9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubqln3Q8C5U9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubqln3Q8C5U9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubqln3Q8C5U9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubqln3Q8C5U9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubqln3Q8C5U9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubqln3Q8C5U9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubqln3Q8C5U9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubqln3Q8C5U9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubqln3Q8C5U9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubqln3Q8C5U9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubqln3Q8C5U9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubqln3Q8C5U9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubqln3Q8C5U9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubqln3Q8C5U9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubqln3Q8C5U9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubqln3Q8C5U9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubqln3Q8C5U9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubqln3Q8C5U9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubqln3Q8C5U9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubqln3Q8C5U9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubqln3Q8C5U9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubqln3Q8C5U9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubqln3Q8C5U9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubqln3Q8C5U9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubqln3Q8C5U9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubqln3Q8C5U9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms