Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cwc22Q8C5N3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cwc22Q8C5N3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cwc22Q8C5N3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cwc22Q8C5N3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cwc22Q8C5N3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cwc22Q8C5N3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cwc22Q8C5N3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cwc22Q8C5N3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cwc22Q8C5N3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cwc22Q8C5N3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cwc22Q8C5N3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cwc22Q8C5N3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cwc22Q8C5N3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cwc22Q8C5N3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cwc22Q8C5N3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cwc22Q8C5N3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cwc22Q8C5N3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cwc22Q8C5N3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cwc22Q8C5N3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cwc22Q8C5N3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cwc22Q8C5N3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cwc22Q8C5N3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cwc22Q8C5N3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cwc22Q8C5N3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cwc22Q8C5N3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cwc22Q8C5N3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cwc22Q8C5N3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cwc22Q8C5N3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cwc22Q8C5N3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cwc22Q8C5N3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cwc22Q8C5N3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Cwc22Q8C5N3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Cwc22Q8C5N3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cwc22Q8C5N3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cwc22Q8C5N3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cwc22Q8C5N3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cwc22Q8C5N3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cwc22Q8C5N3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cwc22Q8C5N3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cwc22Q8C5N3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cwc22Q8C5N3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cwc22Q8C5N3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cwc22Q8C5N3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cwc22Q8C5N3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cwc22Q8C5N3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cwc22Q8C5N3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cwc22Q8C5N3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cwc22Q8C5N3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cwc22Q8C5N3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cwc22Q8C5N3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Cwc22Q8C5N3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cwc22Q8C5N3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cwc22Q8C5N3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cwc22Q8C5N3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cwc22Q8C5N3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cwc22Q8C5N3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cwc22Q8C5N3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cwc22Q8C5N3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cwc22Q8C5N3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cwc22Q8C5N3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cwc22Q8C5N3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Cwc22Q8C5N3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cwc22Q8C5N3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cwc22Q8C5N3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cwc22Q8C5N3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cwc22Q8C5N3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cwc22Q8C5N3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cwc22Q8C5N3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cwc22Q8C5N3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cwc22Q8C5N3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cwc22Q8C5N3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cwc22Q8C5N3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cwc22Q8C5N3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cwc22Q8C5N3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cwc22Q8C5N3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Cwc22Q8C5N3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cwc22Q8C5N3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cwc22Q8C5N3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Cwc22Q8C5N3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cwc22Q8C5N3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cwc22Q8C5N3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cwc22Q8C5N3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cwc22Q8C5N3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cwc22Q8C5N3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cwc22Q8C5N3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cwc22Q8C5N3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cwc22Q8C5N3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cwc22Q8C5N3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cwc22Q8C5N3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cwc22Q8C5N3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cwc22Q8C5N3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Cwc22Q8C5N3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cwc22Q8C5N3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cwc22Q8C5N3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cwc22Q8C5N3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cwc22Q8C5N3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cwc22Q8C5N3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cwc22Q8C5N3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cwc22Q8C5N3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms