Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M10.6Q85ZW5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M10.6Q85ZW5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms