Protein–RNA interactions for Protein: Q810F0

Prima1, Proline-rich membrane anchor 1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prima1Q810F0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prima1Q810F0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prima1Q810F0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prima1Q810F0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prima1Q810F0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prima1Q810F0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prima1Q810F0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prima1Q810F0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prima1Q810F0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prima1Q810F0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prima1Q810F0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prima1Q810F0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prima1Q810F0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prima1Q810F0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prima1Q810F0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prima1Q810F0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prima1Q810F0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prima1Q810F0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prima1Q810F0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prima1Q810F0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prima1Q810F0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prima1Q810F0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prima1Q810F0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prima1Q810F0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prima1Q810F0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prima1Q810F0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prima1Q810F0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Prima1Q810F0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prima1Q810F0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prima1Q810F0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prima1Q810F0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prima1Q810F0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prima1Q810F0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prima1Q810F0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prima1Q810F0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms