Protein–RNA interactions for Protein: Q80U93

Nup214, Nuclear pore complex protein Nup214, mousemouse

Predictions only

Length 2,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup214Q80U93 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nup214Q80U93 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nup214Q80U93 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup214Q80U93 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup214Q80U93 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup214Q80U93 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup214Q80U93 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup214Q80U93 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup214Q80U93 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup214Q80U93 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup214Q80U93 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup214Q80U93 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup214Q80U93 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup214Q80U93 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup214Q80U93 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup214Q80U93 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup214Q80U93 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup214Q80U93 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup214Q80U93 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup214Q80U93 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup214Q80U93 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup214Q80U93 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup214Q80U93 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup214Q80U93 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup214Q80U93 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup214Q80U93 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup214Q80U93 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup214Q80U93 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup214Q80U93 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup214Q80U93 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup214Q80U93 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup214Q80U93 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup214Q80U93 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup214Q80U93 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup214Q80U93 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup214Q80U93 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup214Q80U93 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms