Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pja2Q80U04 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pja2Q80U04 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pja2Q80U04 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pja2Q80U04 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pja2Q80U04 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pja2Q80U04 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pja2Q80U04 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pja2Q80U04 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pja2Q80U04 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pja2Q80U04 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pja2Q80U04 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pja2Q80U04 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pja2Q80U04 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pja2Q80U04 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pja2Q80U04 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pja2Q80U04 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pja2Q80U04 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pja2Q80U04 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pja2Q80U04 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pja2Q80U04 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pja2Q80U04 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pja2Q80U04 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pja2Q80U04 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pja2Q80U04 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pja2Q80U04 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pja2Q80U04 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pja2Q80U04 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pja2Q80U04 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pja2Q80U04 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pja2Q80U04 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pja2Q80U04 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pja2Q80U04 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pja2Q80U04 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pja2Q80U04 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pja2Q80U04 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pja2Q80U04 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pja2Q80U04 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pja2Q80U04 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pja2Q80U04 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pja2Q80U04 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Pja2Q80U04 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pja2Q80U04 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pja2Q80U04 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pja2Q80U04 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pja2Q80U04 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Pja2Q80U04 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pja2Q80U04 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pja2Q80U04 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pja2Q80U04 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pja2Q80U04 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pja2Q80U04 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Pja2Q80U04 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pja2Q80U04 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pja2Q80U04 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pja2Q80U04 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pja2Q80U04 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pja2Q80U04 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pja2Q80U04 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pja2Q80U04 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pja2Q80U04 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pja2Q80U04 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pja2Q80U04 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pja2Q80U04 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pja2Q80U04 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pja2Q80U04 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pja2Q80U04 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pja2Q80U04 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pja2Q80U04 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pja2Q80U04 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pja2Q80U04 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pja2Q80U04 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pja2Q80U04 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pja2Q80U04 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pja2Q80U04 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pja2Q80U04 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Pja2Q80U04 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pja2Q80U04 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pja2Q80U04 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pja2Q80U04 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pja2Q80U04 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pja2Q80U04 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pja2Q80U04 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Pja2Q80U04 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pja2Q80U04 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pja2Q80U04 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pja2Q80U04 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pja2Q80U04 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pja2Q80U04 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms