Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim17Q7TPM3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim17Q7TPM3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim17Q7TPM3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim17Q7TPM3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim17Q7TPM3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim17Q7TPM3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim17Q7TPM3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim17Q7TPM3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim17Q7TPM3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim17Q7TPM3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim17Q7TPM3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim17Q7TPM3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim17Q7TPM3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim17Q7TPM3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trim17Q7TPM3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim17Q7TPM3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim17Q7TPM3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim17Q7TPM3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim17Q7TPM3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim17Q7TPM3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim17Q7TPM3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim17Q7TPM3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim17Q7TPM3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim17Q7TPM3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim17Q7TPM3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim17Q7TPM3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim17Q7TPM3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim17Q7TPM3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim17Q7TPM3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim17Q7TPM3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim17Q7TPM3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim17Q7TPM3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim17Q7TPM3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim17Q7TPM3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim17Q7TPM3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim17Q7TPM3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim17Q7TPM3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trim17Q7TPM3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trim17Q7TPM3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trim17Q7TPM3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trim17Q7TPM3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trim17Q7TPM3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trim17Q7TPM3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trim17Q7TPM3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trim17Q7TPM3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trim17Q7TPM3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trim17Q7TPM3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trim17Q7TPM3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trim17Q7TPM3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trim17Q7TPM3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trim17Q7TPM3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trim17Q7TPM3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trim17Q7TPM3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trim17Q7TPM3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Trim17Q7TPM3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trim17Q7TPM3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trim17Q7TPM3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trim17Q7TPM3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trim17Q7TPM3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trim17Q7TPM3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Trim17Q7TPM3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Trim17Q7TPM3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trim17Q7TPM3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trim17Q7TPM3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trim17Q7TPM3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trim17Q7TPM3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trim17Q7TPM3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trim17Q7TPM3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trim17Q7TPM3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trim17Q7TPM3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trim17Q7TPM3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trim17Q7TPM3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Trim17Q7TPM3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trim17Q7TPM3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trim17Q7TPM3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trim17Q7TPM3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trim17Q7TPM3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trim17Q7TPM3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trim17Q7TPM3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trim17Q7TPM3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trim17Q7TPM3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trim17Q7TPM3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trim17Q7TPM3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trim17Q7TPM3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Trim17Q7TPM3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Trim17Q7TPM3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trim17Q7TPM3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trim17Q7TPM3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trim17Q7TPM3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trim17Q7TPM3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trim17Q7TPM3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Trim17Q7TPM3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trim17Q7TPM3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trim17Q7TPM3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trim17Q7TPM3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Trim17Q7TPM3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trim17Q7TPM3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trim17Q7TPM3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trim17Q7TPM3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms