Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Atp8b3Q6UQ17 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp8b3Q6UQ17 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp8b3Q6UQ17 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp8b3Q6UQ17 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp8b3Q6UQ17 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp8b3Q6UQ17 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp8b3Q6UQ17 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp8b3Q6UQ17 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp8b3Q6UQ17 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp8b3Q6UQ17 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp8b3Q6UQ17 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp8b3Q6UQ17 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp8b3Q6UQ17 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp8b3Q6UQ17 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp8b3Q6UQ17 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp8b3Q6UQ17 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp8b3Q6UQ17 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp8b3Q6UQ17 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp8b3Q6UQ17 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp8b3Q6UQ17 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp8b3Q6UQ17 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp8b3Q6UQ17 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp8b3Q6UQ17 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp8b3Q6UQ17 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp8b3Q6UQ17 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp8b3Q6UQ17 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp8b3Q6UQ17 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp8b3Q6UQ17 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp8b3Q6UQ17 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp8b3Q6UQ17 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp8b3Q6UQ17 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp8b3Q6UQ17 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp8b3Q6UQ17 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp8b3Q6UQ17 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp8b3Q6UQ17 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp8b3Q6UQ17 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp8b3Q6UQ17 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp8b3Q6UQ17 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp8b3Q6UQ17 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp8b3Q6UQ17 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp8b3Q6UQ17 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp8b3Q6UQ17 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp8b3Q6UQ17 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp8b3Q6UQ17 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp8b3Q6UQ17 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp8b3Q6UQ17 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms