Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN3

Ttbk1, Tau-tubulin kinase 1, mousemouse

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Length 1,308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttbk1Q6PCN3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ttbk1Q6PCN3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ttbk1Q6PCN3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ttbk1Q6PCN3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ttbk1Q6PCN3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ttbk1Q6PCN3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ttbk1Q6PCN3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ttbk1Q6PCN3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ttbk1Q6PCN3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ttbk1Q6PCN3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ttbk1Q6PCN3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ttbk1Q6PCN3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ttbk1Q6PCN3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ttbk1Q6PCN3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ttbk1Q6PCN3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ttbk1Q6PCN3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ttbk1Q6PCN3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ttbk1Q6PCN3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ttbk1Q6PCN3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ttbk1Q6PCN3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ttbk1Q6PCN3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ttbk1Q6PCN3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ttbk1Q6PCN3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ttbk1Q6PCN3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ttbk1Q6PCN3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ttbk1Q6PCN3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ttbk1Q6PCN3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ttbk1Q6PCN3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ttbk1Q6PCN3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ttbk1Q6PCN3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ttbk1Q6PCN3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ttbk1Q6PCN3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ttbk1Q6PCN3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ttbk1Q6PCN3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ttbk1Q6PCN3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ttbk1Q6PCN3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ttbk1Q6PCN3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ttbk1Q6PCN3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ttbk1Q6PCN3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ttbk1Q6PCN3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ttbk1Q6PCN3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ttbk1Q6PCN3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ttbk1Q6PCN3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ttbk1Q6PCN3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ttbk1Q6PCN3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ttbk1Q6PCN3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ttbk1Q6PCN3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ttbk1Q6PCN3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ttbk1Q6PCN3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ttbk1Q6PCN3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ttbk1Q6PCN3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ttbk1Q6PCN3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ttbk1Q6PCN3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ttbk1Q6PCN3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ttbk1Q6PCN3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ttbk1Q6PCN3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ttbk1Q6PCN3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ttbk1Q6PCN3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Ttbk1Q6PCN3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Ttbk1Q6PCN3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Ttbk1Q6PCN3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ttbk1Q6PCN3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ttbk1Q6PCN3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Ttbk1Q6PCN3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ttbk1Q6PCN3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Ttbk1Q6PCN3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Ttbk1Q6PCN3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Ttbk1Q6PCN3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ttbk1Q6PCN3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ttbk1Q6PCN3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ttbk1Q6PCN3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Ttbk1Q6PCN3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Ttbk1Q6PCN3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
Ttbk1Q6PCN3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
Ttbk1Q6PCN3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Ttbk1Q6PCN3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Ttbk1Q6PCN3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ttbk1Q6PCN3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ttbk1Q6PCN3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ttbk1Q6PCN3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ttbk1Q6PCN3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ttbk1Q6PCN3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ttbk1Q6PCN3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ttbk1Q6PCN3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ttbk1Q6PCN3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ttbk1Q6PCN3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ttbk1Q6PCN3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ttbk1Q6PCN3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ttbk1Q6PCN3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ttbk1Q6PCN3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ttbk1Q6PCN3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ttbk1Q6PCN3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ttbk1Q6PCN3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ttbk1Q6PCN3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ttbk1Q6PCN3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ttbk1Q6PCN3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ttbk1Q6PCN3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ttbk1Q6PCN3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ttbk1Q6PCN3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ttbk1Q6PCN3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
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