Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smchd1Q6P5D8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smchd1Q6P5D8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smchd1Q6P5D8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Smchd1Q6P5D8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Smchd1Q6P5D8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smchd1Q6P5D8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smchd1Q6P5D8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smchd1Q6P5D8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smchd1Q6P5D8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Smchd1Q6P5D8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Smchd1Q6P5D8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smchd1Q6P5D8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smchd1Q6P5D8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smchd1Q6P5D8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smchd1Q6P5D8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Smchd1Q6P5D8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Smchd1Q6P5D8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smchd1Q6P5D8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smchd1Q6P5D8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smchd1Q6P5D8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smchd1Q6P5D8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smchd1Q6P5D8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smchd1Q6P5D8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smchd1Q6P5D8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smchd1Q6P5D8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smchd1Q6P5D8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smchd1Q6P5D8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smchd1Q6P5D8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smchd1Q6P5D8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smchd1Q6P5D8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smchd1Q6P5D8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smchd1Q6P5D8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smchd1Q6P5D8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smchd1Q6P5D8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smchd1Q6P5D8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smchd1Q6P5D8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smchd1Q6P5D8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smchd1Q6P5D8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smchd1Q6P5D8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smchd1Q6P5D8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smchd1Q6P5D8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smchd1Q6P5D8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smchd1Q6P5D8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smchd1Q6P5D8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smchd1Q6P5D8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smchd1Q6P5D8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smchd1Q6P5D8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smchd1Q6P5D8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smchd1Q6P5D8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smchd1Q6P5D8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smchd1Q6P5D8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smchd1Q6P5D8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smchd1Q6P5D8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms