Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NipblQ6KCD5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms