Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clcn1Q64347 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clcn1Q64347 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clcn1Q64347 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Clcn1Q64347 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clcn1Q64347 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clcn1Q64347 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clcn1Q64347 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clcn1Q64347 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clcn1Q64347 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Clcn1Q64347 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Clcn1Q64347 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Clcn1Q64347 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Clcn1Q64347 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Clcn1Q64347 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Clcn1Q64347 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Clcn1Q64347 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clcn1Q64347 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clcn1Q64347 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clcn1Q64347 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clcn1Q64347 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clcn1Q64347 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clcn1Q64347 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clcn1Q64347 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Clcn1Q64347 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clcn1Q64347 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clcn1Q64347 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clcn1Q64347 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clcn1Q64347 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clcn1Q64347 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clcn1Q64347 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clcn1Q64347 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clcn1Q64347 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clcn1Q64347 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clcn1Q64347 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clcn1Q64347 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Clcn1Q64347 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Clcn1Q64347 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Clcn1Q64347 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Clcn1Q64347 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Clcn1Q64347 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Clcn1Q64347 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Clcn1Q64347 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Clcn1Q64347 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clcn1Q64347 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clcn1Q64347 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clcn1Q64347 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clcn1Q64347 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clcn1Q64347 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clcn1Q64347 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clcn1Q64347 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clcn1Q64347 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clcn1Q64347 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clcn1Q64347 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clcn1Q64347 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clcn1Q64347 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Clcn1Q64347 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clcn1Q64347 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clcn1Q64347 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clcn1Q64347 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clcn1Q64347 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clcn1Q64347 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clcn1Q64347 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clcn1Q64347 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clcn1Q64347 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clcn1Q64347 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clcn1Q64347 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clcn1Q64347 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clcn1Q64347 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clcn1Q64347 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clcn1Q64347 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clcn1Q64347 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clcn1Q64347 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clcn1Q64347 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clcn1Q64347 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clcn1Q64347 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clcn1Q64347 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clcn1Q64347 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clcn1Q64347 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Clcn1Q64347 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Clcn1Q64347 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clcn1Q64347 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clcn1Q64347 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clcn1Q64347 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clcn1Q64347 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clcn1Q64347 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clcn1Q64347 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clcn1Q64347 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clcn1Q64347 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Clcn1Q64347 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clcn1Q64347 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clcn1Q64347 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clcn1Q64347 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clcn1Q64347 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clcn1Q64347 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clcn1Q64347 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Clcn1Q64347 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clcn1Q64347 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clcn1Q64347 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clcn1Q64347 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms