Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pou4f3Q63955 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms