Protein–RNA interactions for Protein: Q62270

Srms, Tyrosine-protein kinase Srms, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrmsQ62270 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrmsQ62270 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SrmsQ62270 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrmsQ62270 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrmsQ62270 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrmsQ62270 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrmsQ62270 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SrmsQ62270 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrmsQ62270 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrmsQ62270 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrmsQ62270 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrmsQ62270 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SrmsQ62270 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrmsQ62270 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrmsQ62270 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrmsQ62270 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrmsQ62270 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrmsQ62270 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SrmsQ62270 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms