Protein–RNA interactions for Protein: Q62234

Myom1, Myomesin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myom1Q62234 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Myom1Q62234 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Myom1Q62234 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Myom1Q62234 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Myom1Q62234 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Myom1Q62234 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Myom1Q62234 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Myom1Q62234 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Myom1Q62234 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Myom1Q62234 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Myom1Q62234 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Myom1Q62234 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Myom1Q62234 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Myom1Q62234 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Myom1Q62234 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Myom1Q62234 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Myom1Q62234 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Myom1Q62234 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Myom1Q62234 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Myom1Q62234 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Myom1Q62234 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Myom1Q62234 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Myom1Q62234 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Myom1Q62234 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Myom1Q62234 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Myom1Q62234 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Myom1Q62234 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Myom1Q62234 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Myom1Q62234 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Myom1Q62234 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Myom1Q62234 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Myom1Q62234 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Myom1Q62234 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Myom1Q62234 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Myom1Q62234 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Myom1Q62234 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Myom1Q62234 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Myom1Q62234 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Myom1Q62234 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Myom1Q62234 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Myom1Q62234 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Myom1Q62234 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Myom1Q62234 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Myom1Q62234 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Myom1Q62234 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Myom1Q62234 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Myom1Q62234 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Myom1Q62234 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Myom1Q62234 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Myom1Q62234 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Myom1Q62234 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Myom1Q62234 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Myom1Q62234 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Myom1Q62234 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Myom1Q62234 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Myom1Q62234 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Myom1Q62234 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Myom1Q62234 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Myom1Q62234 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Myom1Q62234 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Myom1Q62234 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Myom1Q62234 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Myom1Q62234 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Myom1Q62234 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Myom1Q62234 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Myom1Q62234 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Myom1Q62234 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Myom1Q62234 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Myom1Q62234 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Myom1Q62234 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Myom1Q62234 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Myom1Q62234 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Myom1Q62234 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Myom1Q62234 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Myom1Q62234 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Myom1Q62234 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Myom1Q62234 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Myom1Q62234 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Myom1Q62234 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Myom1Q62234 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Myom1Q62234 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Myom1Q62234 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Myom1Q62234 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Myom1Q62234 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Myom1Q62234 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Myom1Q62234 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
Myom1Q62234 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Myom1Q62234 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Myom1Q62234 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Myom1Q62234 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Myom1Q62234 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Myom1Q62234 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Myom1Q62234 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Myom1Q62234 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Myom1Q62234 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Myom1Q62234 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Myom1Q62234 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Myom1Q62234 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Myom1Q62234 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Myom1Q62234 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.1 ms