Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Traf3Q60803 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Traf3Q60803 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Traf3Q60803 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Traf3Q60803 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Traf3Q60803 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Traf3Q60803 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Traf3Q60803 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Traf3Q60803 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf3Q60803 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf3Q60803 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf3Q60803 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf3Q60803 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf3Q60803 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf3Q60803 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf3Q60803 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf3Q60803 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf3Q60803 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf3Q60803 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf3Q60803 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf3Q60803 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf3Q60803 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf3Q60803 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf3Q60803 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf3Q60803 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf3Q60803 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf3Q60803 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf3Q60803 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Traf3Q60803 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Traf3Q60803 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Traf3Q60803 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Traf3Q60803 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Traf3Q60803 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Traf3Q60803 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms