Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb6Q60692 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms