Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Rapgef6Q5NCJ1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rapgef6Q5NCJ1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rapgef6Q5NCJ1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Rapgef6Q5NCJ1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rapgef6Q5NCJ1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rapgef6Q5NCJ1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rapgef6Q5NCJ1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Rapgef6Q5NCJ1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rapgef6Q5NCJ1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rapgef6Q5NCJ1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rapgef6Q5NCJ1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Rapgef6Q5NCJ1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Rapgef6Q5NCJ1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rapgef6Q5NCJ1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rapgef6Q5NCJ1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rapgef6Q5NCJ1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rapgef6Q5NCJ1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rapgef6Q5NCJ1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rapgef6Q5NCJ1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rapgef6Q5NCJ1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rapgef6Q5NCJ1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rapgef6Q5NCJ1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rapgef6Q5NCJ1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Rapgef6Q5NCJ1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rapgef6Q5NCJ1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rapgef6Q5NCJ1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rapgef6Q5NCJ1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rapgef6Q5NCJ1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rapgef6Q5NCJ1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rapgef6Q5NCJ1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rapgef6Q5NCJ1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rapgef6Q5NCJ1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rapgef6Q5NCJ1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rapgef6Q5NCJ1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rapgef6Q5NCJ1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rapgef6Q5NCJ1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rapgef6Q5NCJ1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rapgef6Q5NCJ1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rapgef6Q5NCJ1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Rapgef6Q5NCJ1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Rapgef6Q5NCJ1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Rapgef6Q5NCJ1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Rapgef6Q5NCJ1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Rapgef6Q5NCJ1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Rapgef6Q5NCJ1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Rapgef6Q5NCJ1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Rapgef6Q5NCJ1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Rapgef6Q5NCJ1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Rapgef6Q5NCJ1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Rapgef6Q5NCJ1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Rapgef6Q5NCJ1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rapgef6Q5NCJ1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rapgef6Q5NCJ1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Rapgef6Q5NCJ1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Rapgef6Q5NCJ1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Rapgef6Q5NCJ1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Rapgef6Q5NCJ1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Rapgef6Q5NCJ1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Rapgef6Q5NCJ1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Rapgef6Q5NCJ1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Rapgef6Q5NCJ1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Rapgef6Q5NCJ1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Rapgef6Q5NCJ1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Rapgef6Q5NCJ1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Rapgef6Q5NCJ1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Rapgef6Q5NCJ1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Rapgef6Q5NCJ1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Rapgef6Q5NCJ1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Rapgef6Q5NCJ1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Rapgef6Q5NCJ1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Rapgef6Q5NCJ1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Rapgef6Q5NCJ1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Rapgef6Q5NCJ1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Rapgef6Q5NCJ1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Rapgef6Q5NCJ1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Rapgef6Q5NCJ1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Rapgef6Q5NCJ1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Rapgef6Q5NCJ1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Rapgef6Q5NCJ1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Rapgef6Q5NCJ1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Rapgef6Q5NCJ1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Rapgef6Q5NCJ1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Rapgef6Q5NCJ1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Rapgef6Q5NCJ1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Rapgef6Q5NCJ1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Rapgef6Q5NCJ1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Rapgef6Q5NCJ1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Rapgef6Q5NCJ1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Rapgef6Q5NCJ1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Rapgef6Q5NCJ1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Rapgef6Q5NCJ1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Rapgef6Q5NCJ1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Rapgef6Q5NCJ1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Rapgef6Q5NCJ1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Rapgef6Q5NCJ1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Rapgef6Q5NCJ1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Rapgef6Q5NCJ1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms