Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc1Q5NCF2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc1Q5NCF2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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