Protein–RNA interactions for Protein: Q56A06

Tmtc2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc2Q56A06 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmtc2Q56A06 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmtc2Q56A06 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmtc2Q56A06 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmtc2Q56A06 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmtc2Q56A06 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmtc2Q56A06 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmtc2Q56A06 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmtc2Q56A06 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmtc2Q56A06 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmtc2Q56A06 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmtc2Q56A06 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmtc2Q56A06 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmtc2Q56A06 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmtc2Q56A06 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmtc2Q56A06 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmtc2Q56A06 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmtc2Q56A06 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmtc2Q56A06 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmtc2Q56A06 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmtc2Q56A06 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmtc2Q56A06 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmtc2Q56A06 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmtc2Q56A06 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmtc2Q56A06 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmtc2Q56A06 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmtc2Q56A06 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmtc2Q56A06 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmtc2Q56A06 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmtc2Q56A06 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmtc2Q56A06 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmtc2Q56A06 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmtc2Q56A06 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmtc2Q56A06 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmtc2Q56A06 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmtc2Q56A06 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmtc2Q56A06 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmtc2Q56A06 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmtc2Q56A06 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmtc2Q56A06 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmtc2Q56A06 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmtc2Q56A06 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmtc2Q56A06 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmtc2Q56A06 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmtc2Q56A06 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmtc2Q56A06 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmtc2Q56A06 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmtc2Q56A06 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmtc2Q56A06 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmtc2Q56A06 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmtc2Q56A06 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmtc2Q56A06 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmtc2Q56A06 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmtc2Q56A06 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmtc2Q56A06 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmtc2Q56A06 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmtc2Q56A06 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmtc2Q56A06 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmtc2Q56A06 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmtc2Q56A06 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmtc2Q56A06 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmtc2Q56A06 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmtc2Q56A06 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmtc2Q56A06 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmtc2Q56A06 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmtc2Q56A06 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmtc2Q56A06 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmtc2Q56A06 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmtc2Q56A06 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmtc2Q56A06 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmtc2Q56A06 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmtc2Q56A06 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms