Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BC051142Q3V0M8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BC051142Q3V0M8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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