Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skap1Q3UUV5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skap1Q3UUV5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms