Protein–RNA interactions for Protein: Q3USH5

Sfswap, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfswapQ3USH5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SfswapQ3USH5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SfswapQ3USH5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SfswapQ3USH5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SfswapQ3USH5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SfswapQ3USH5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SfswapQ3USH5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SfswapQ3USH5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SfswapQ3USH5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SfswapQ3USH5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SfswapQ3USH5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SfswapQ3USH5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SfswapQ3USH5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SfswapQ3USH5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SfswapQ3USH5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SfswapQ3USH5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SfswapQ3USH5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SfswapQ3USH5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SfswapQ3USH5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SfswapQ3USH5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SfswapQ3USH5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SfswapQ3USH5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SfswapQ3USH5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SfswapQ3USH5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SfswapQ3USH5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SfswapQ3USH5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SfswapQ3USH5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SfswapQ3USH5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SfswapQ3USH5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SfswapQ3USH5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SfswapQ3USH5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SfswapQ3USH5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SfswapQ3USH5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SfswapQ3USH5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SfswapQ3USH5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SfswapQ3USH5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SfswapQ3USH5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SfswapQ3USH5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms