Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Lmod2Q3UHZ5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Lmod2Q3UHZ5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Lmod2Q3UHZ5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Lmod2Q3UHZ5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Lmod2Q3UHZ5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Lmod2Q3UHZ5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Lmod2Q3UHZ5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Lmod2Q3UHZ5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Lmod2Q3UHZ5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Lmod2Q3UHZ5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Lmod2Q3UHZ5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Lmod2Q3UHZ5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Lmod2Q3UHZ5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Lmod2Q3UHZ5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Lmod2Q3UHZ5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Lmod2Q3UHZ5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Lmod2Q3UHZ5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Lmod2Q3UHZ5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Lmod2Q3UHZ5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Lmod2Q3UHZ5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Lmod2Q3UHZ5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Lmod2Q3UHZ5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Lmod2Q3UHZ5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Lmod2Q3UHZ5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Lmod2Q3UHZ5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Lmod2Q3UHZ5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Lmod2Q3UHZ5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Lmod2Q3UHZ5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Lmod2Q3UHZ5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Lmod2Q3UHZ5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Lmod2Q3UHZ5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Lmod2Q3UHZ5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Lmod2Q3UHZ5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Lmod2Q3UHZ5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Lmod2Q3UHZ5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Lmod2Q3UHZ5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Lmod2Q3UHZ5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Lmod2Q3UHZ5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Lmod2Q3UHZ5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Lmod2Q3UHZ5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Lmod2Q3UHZ5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Lmod2Q3UHZ5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Lmod2Q3UHZ5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Lmod2Q3UHZ5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Lmod2Q3UHZ5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Lmod2Q3UHZ5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Lmod2Q3UHZ5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Lmod2Q3UHZ5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Lmod2Q3UHZ5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Lmod2Q3UHZ5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Lmod2Q3UHZ5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Lmod2Q3UHZ5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Lmod2Q3UHZ5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Lmod2Q3UHZ5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Lmod2Q3UHZ5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Lmod2Q3UHZ5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Lmod2Q3UHZ5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Lmod2Q3UHZ5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Lmod2Q3UHZ5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Lmod2Q3UHZ5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Lmod2Q3UHZ5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Lmod2Q3UHZ5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Lmod2Q3UHZ5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Lmod2Q3UHZ5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Lmod2Q3UHZ5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Lmod2Q3UHZ5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Lmod2Q3UHZ5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Lmod2Q3UHZ5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Lmod2Q3UHZ5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Lmod2Q3UHZ5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Lmod2Q3UHZ5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Lmod2Q3UHZ5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Lmod2Q3UHZ5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Lmod2Q3UHZ5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Lmod2Q3UHZ5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Lmod2Q3UHZ5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Lmod2Q3UHZ5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Lmod2Q3UHZ5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Lmod2Q3UHZ5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Lmod2Q3UHZ5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Lmod2Q3UHZ5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Lmod2Q3UHZ5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Lmod2Q3UHZ5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Lmod2Q3UHZ5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Lmod2Q3UHZ5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Lmod2Q3UHZ5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Lmod2Q3UHZ5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Lmod2Q3UHZ5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Lmod2Q3UHZ5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
Lmod2Q3UHZ5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Lmod2Q3UHZ5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Lmod2Q3UHZ5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Lmod2Q3UHZ5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Lmod2Q3UHZ5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Lmod2Q3UHZ5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Lmod2Q3UHZ5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Lmod2Q3UHZ5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Lmod2Q3UHZ5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Lmod2Q3UHZ5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms