Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkx6-3Q3UHX8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nkx6-3Q3UHX8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nkx6-3Q3UHX8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nkx6-3Q3UHX8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nkx6-3Q3UHX8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Nkx6-3Q3UHX8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nkx6-3Q3UHX8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nkx6-3Q3UHX8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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Nkx6-3Q3UHX8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nkx6-3Q3UHX8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nkx6-3Q3UHX8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
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Nkx6-3Q3UHX8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nkx6-3Q3UHX8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nkx6-3Q3UHX8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nkx6-3Q3UHX8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nkx6-3Q3UHX8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nkx6-3Q3UHX8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nkx6-3Q3UHX8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nkx6-3Q3UHX8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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Nkx6-3Q3UHX8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nkx6-3Q3UHX8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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Nkx6-3Q3UHX8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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Nkx6-3Q3UHX8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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Nkx6-3Q3UHX8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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Nkx6-3Q3UHX8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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Nkx6-3Q3UHX8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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Nkx6-3Q3UHX8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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Nkx6-3Q3UHX8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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Nkx6-3Q3UHX8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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Nkx6-3Q3UHX8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms