Protein–RNA interactions for Protein: Q3UAW9

Brf2, Transcription factor IIIB 50 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf2Q3UAW9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Brf2Q3UAW9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brf2Q3UAW9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms