Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc10Q3TLI0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trappc10Q3TLI0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc10Q3TLI0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms