Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim43aQ3TL54 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim43aQ3TL54 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trim43aQ3TL54 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trim43aQ3TL54 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim43aQ3TL54 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim43aQ3TL54 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim43aQ3TL54 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim43aQ3TL54 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim43aQ3TL54 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim43aQ3TL54 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim43aQ3TL54 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim43aQ3TL54 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim43aQ3TL54 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim43aQ3TL54 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim43aQ3TL54 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim43aQ3TL54 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim43aQ3TL54 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim43aQ3TL54 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim43aQ3TL54 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim43aQ3TL54 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim43aQ3TL54 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim43aQ3TL54 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim43aQ3TL54 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim43aQ3TL54 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim43aQ3TL54 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim43aQ3TL54 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim43aQ3TL54 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim43aQ3TL54 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim43aQ3TL54 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim43aQ3TL54 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim43aQ3TL54 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim43aQ3TL54 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim43aQ3TL54 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim43aQ3TL54 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim43aQ3TL54 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim43aQ3TL54 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms