Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDV8

Zfp444, Zinc finger protein 444, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp444Q3TDV8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zfp444Q3TDV8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Zfp444Q3TDV8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Zfp444Q3TDV8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Zfp444Q3TDV8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Zfp444Q3TDV8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Zfp444Q3TDV8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Zfp444Q3TDV8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Zfp444Q3TDV8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Zfp444Q3TDV8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Zfp444Q3TDV8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Zfp444Q3TDV8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Zfp444Q3TDV8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Zfp444Q3TDV8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Zfp444Q3TDV8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Zfp444Q3TDV8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Zfp444Q3TDV8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Zfp444Q3TDV8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Zfp444Q3TDV8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Zfp444Q3TDV8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Zfp444Q3TDV8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Zfp444Q3TDV8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Zfp444Q3TDV8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Zfp444Q3TDV8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Zfp444Q3TDV8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zfp444Q3TDV8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zfp444Q3TDV8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zfp444Q3TDV8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zfp444Q3TDV8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zfp444Q3TDV8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Zfp444Q3TDV8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Zfp444Q3TDV8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Zfp444Q3TDV8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Zfp444Q3TDV8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Zfp444Q3TDV8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Zfp444Q3TDV8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Zfp444Q3TDV8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Zfp444Q3TDV8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Zfp444Q3TDV8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Zfp444Q3TDV8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Zfp444Q3TDV8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Zfp444Q3TDV8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Zfp444Q3TDV8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Zfp444Q3TDV8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Zfp444Q3TDV8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Zfp444Q3TDV8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Zfp444Q3TDV8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Zfp444Q3TDV8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Zfp444Q3TDV8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Zfp444Q3TDV8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Zfp444Q3TDV8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Zfp444Q3TDV8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Zfp444Q3TDV8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Zfp444Q3TDV8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Zfp444Q3TDV8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Zfp444Q3TDV8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Zfp444Q3TDV8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Zfp444Q3TDV8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Zfp444Q3TDV8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Zfp444Q3TDV8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Zfp444Q3TDV8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Zfp444Q3TDV8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Zfp444Q3TDV8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Zfp444Q3TDV8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Zfp444Q3TDV8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Zfp444Q3TDV8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Zfp444Q3TDV8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Zfp444Q3TDV8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Zfp444Q3TDV8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Zfp444Q3TDV8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Zfp444Q3TDV8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Zfp444Q3TDV8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Zfp444Q3TDV8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Zfp444Q3TDV8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zfp444Q3TDV8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zfp444Q3TDV8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zfp444Q3TDV8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.3 ms