Protein–RNA interactions for Protein: Q2KN98

Specc1l, Cytospin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1lQ2KN98 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Specc1lQ2KN98 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Specc1lQ2KN98 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Specc1lQ2KN98 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Specc1lQ2KN98 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Specc1lQ2KN98 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Specc1lQ2KN98 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Specc1lQ2KN98 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Specc1lQ2KN98 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Specc1lQ2KN98 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Specc1lQ2KN98 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Specc1lQ2KN98 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Specc1lQ2KN98 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Specc1lQ2KN98 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Specc1lQ2KN98 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Specc1lQ2KN98 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Specc1lQ2KN98 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Specc1lQ2KN98 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Specc1lQ2KN98 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Specc1lQ2KN98 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Specc1lQ2KN98 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Specc1lQ2KN98 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Specc1lQ2KN98 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Specc1lQ2KN98 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Specc1lQ2KN98 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Specc1lQ2KN98 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Specc1lQ2KN98 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Specc1lQ2KN98 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Specc1lQ2KN98 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Specc1lQ2KN98 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Specc1lQ2KN98 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Specc1lQ2KN98 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Specc1lQ2KN98 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Specc1lQ2KN98 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Specc1lQ2KN98 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Specc1lQ2KN98 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Specc1lQ2KN98 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Specc1lQ2KN98 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Specc1lQ2KN98 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Specc1lQ2KN98 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Specc1lQ2KN98 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Specc1lQ2KN98 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Specc1lQ2KN98 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Specc1lQ2KN98 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Specc1lQ2KN98 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Specc1lQ2KN98 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Specc1lQ2KN98 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Specc1lQ2KN98 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Specc1lQ2KN98 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Specc1lQ2KN98 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Specc1lQ2KN98 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Specc1lQ2KN98 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Specc1lQ2KN98 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Specc1lQ2KN98 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Specc1lQ2KN98 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Specc1lQ2KN98 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Specc1lQ2KN98 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Specc1lQ2KN98 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Specc1lQ2KN98 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Specc1lQ2KN98 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Specc1lQ2KN98 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Specc1lQ2KN98 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Specc1lQ2KN98 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Specc1lQ2KN98 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Specc1lQ2KN98 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Specc1lQ2KN98 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Specc1lQ2KN98 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Specc1lQ2KN98 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Specc1lQ2KN98 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Specc1lQ2KN98 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Specc1lQ2KN98 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Specc1lQ2KN98 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Specc1lQ2KN98 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Specc1lQ2KN98 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Specc1lQ2KN98 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Specc1lQ2KN98 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Specc1lQ2KN98 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Specc1lQ2KN98 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Specc1lQ2KN98 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Specc1lQ2KN98 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Specc1lQ2KN98 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Specc1lQ2KN98 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Specc1lQ2KN98 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Specc1lQ2KN98 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Specc1lQ2KN98 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Specc1lQ2KN98 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Specc1lQ2KN98 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Specc1lQ2KN98 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Specc1lQ2KN98 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Specc1lQ2KN98 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Specc1lQ2KN98 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Specc1lQ2KN98 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Specc1lQ2KN98 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Specc1lQ2KN98 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Specc1lQ2KN98 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Specc1lQ2KN98 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Specc1lQ2KN98 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Specc1lQ2KN98 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Specc1lQ2KN98 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Specc1lQ2KN98 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms