Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ptchd1Q14B62 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ptchd1Q14B62 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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