Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU8

Bpifa6, BPI fold-containing family A, member 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bpifa6Q0VGU8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bpifa6Q0VGU8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Bpifa6Q0VGU8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bpifa6Q0VGU8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bpifa6Q0VGU8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bpifa6Q0VGU8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bpifa6Q0VGU8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bpifa6Q0VGU8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bpifa6Q0VGU8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bpifa6Q0VGU8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bpifa6Q0VGU8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bpifa6Q0VGU8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bpifa6Q0VGU8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Bpifa6Q0VGU8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms