Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MitfQ08874 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MitfQ08874 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MitfQ08874 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MitfQ08874 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MitfQ08874 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MitfQ08874 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms