Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MestQ07646 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MestQ07646 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MestQ07646 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MestQ07646 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MestQ07646 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MestQ07646 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MestQ07646 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MestQ07646 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MestQ07646 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MestQ07646 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MestQ07646 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MestQ07646 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MestQ07646 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MestQ07646 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MestQ07646 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MestQ07646 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MestQ07646 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MestQ07646 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MestQ07646 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MestQ07646 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MestQ07646 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MestQ07646 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MestQ07646 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MestQ07646 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MestQ07646 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MestQ07646 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
MestQ07646 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MestQ07646 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MestQ07646 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MestQ07646 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MestQ07646 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MestQ07646 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MestQ07646 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MestQ07646 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
MestQ07646 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MestQ07646 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MestQ07646 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MestQ07646 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MestQ07646 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MestQ07646 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MestQ07646 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MestQ07646 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MestQ07646 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MestQ07646 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MestQ07646 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MestQ07646 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MestQ07646 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MestQ07646 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MestQ07646 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MestQ07646 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MestQ07646 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MestQ07646 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MestQ07646 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MestQ07646 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MestQ07646 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MestQ07646 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MestQ07646 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MestQ07646 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MestQ07646 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MestQ07646 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MestQ07646 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MestQ07646 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MestQ07646 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MestQ07646 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MestQ07646 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MestQ07646 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MestQ07646 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MestQ07646 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MestQ07646 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MestQ07646 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MestQ07646 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MestQ07646 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MestQ07646 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MestQ07646 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MestQ07646 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MestQ07646 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MestQ07646 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MestQ07646 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MestQ07646 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MestQ07646 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MestQ07646 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MestQ07646 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MestQ07646 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MestQ07646 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MestQ07646 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MestQ07646 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MestQ07646 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MestQ07646 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MestQ07646 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MestQ07646 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MestQ07646 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MestQ07646 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MestQ07646 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MestQ07646 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MestQ07646 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MestQ07646 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MestQ07646 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MestQ07646 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MestQ07646 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 196.5 ms