Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sox12Q04890 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sox12Q04890 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sox12Q04890 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sox12Q04890 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sox12Q04890 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sox12Q04890 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Sox12Q04890 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Sox12Q04890 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Sox12Q04890 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sox12Q04890 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sox12Q04890 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sox12Q04890 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sox12Q04890 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Sox12Q04890 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sox12Q04890 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sox12Q04890 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sox12Q04890 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Sox12Q04890 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sox12Q04890 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sox12Q04890 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sox12Q04890 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sox12Q04890 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sox12Q04890 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sox12Q04890 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sox12Q04890 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sox12Q04890 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sox12Q04890 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sox12Q04890 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sox12Q04890 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sox12Q04890 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sox12Q04890 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sox12Q04890 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sox12Q04890 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sox12Q04890 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sox12Q04890 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sox12Q04890 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sox12Q04890 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sox12Q04890 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sox12Q04890 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sox12Q04890 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sox12Q04890 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sox12Q04890 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sox12Q04890 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sox12Q04890 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sox12Q04890 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sox12Q04890 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sox12Q04890 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sox12Q04890 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sox12Q04890 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sox12Q04890 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Sox12Q04890 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sox12Q04890 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sox12Q04890 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sox12Q04890 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sox12Q04890 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sox12Q04890 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sox12Q04890 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sox12Q04890 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sox12Q04890 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sox12Q04890 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sox12Q04890 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sox12Q04890 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Sox12Q04890 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sox12Q04890 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sox12Q04890 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sox12Q04890 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sox12Q04890 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sox12Q04890 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sox12Q04890 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Sox12Q04890 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sox12Q04890 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sox12Q04890 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sox12Q04890 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sox12Q04890 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sox12Q04890 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sox12Q04890 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sox12Q04890 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sox12Q04890 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sox12Q04890 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sox12Q04890 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sox12Q04890 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sox12Q04890 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sox12Q04890 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sox12Q04890 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sox12Q04890 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sox12Q04890 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sox12Q04890 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sox12Q04890 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sox12Q04890 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sox12Q04890 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sox12Q04890 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sox12Q04890 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sox12Q04890 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Sox12Q04890 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sox12Q04890 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sox12Q04890 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sox12Q04890 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sox12Q04890 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sox12Q04890 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms