Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pfdn6Q03958 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pfdn6Q03958 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms